Suite à l’attaque terroriste menée par Haïtani sur le siège de l’Amagi Corporation, Jin et ses compagnons se ruent vers la tour pour empêcher le massacre. Mais leur chemin est parsemé d’embûches et d'adversaires. Pendant ce temps, Koga – complètement déboussolé par la trahison dont il a été victime – n’est pas au bout de ses surprises…