Lumina et ses amis se retrouvent dans les sous-sols de Tokyo, afin de sauver la grande prêtresse de vie Ruri. C'est là qu'attend le manipulateur de l'eau, Tail, qui, malgré sa première victoire à la surface contre Lumina, succombe aux nouveaux pouvoirs de manipulation du vent de ce dernier. De son côté, Ruri tente de s'évader de l'emprise de la Compagnie, aidée par la jeune manipulatrice de l'électricité Ciel. C'est cependant sans compter sur l'intervention de Pyron, qui guettait les deux jeunes filles. Ciel tente le tout pour le tout pour permettre à Ruri de s'enfuir, mais c'était sous-estimer la puissance du numéro 2 de la Compagnie...