Après avoir fait face aux défis des Pandora des classes supérieures, Kazuya et Satellizer se rapprochent de plus en plus. Soudain, les terribles Nova attaquent ! Les Pandora sont alors déployées, mais plusieurs d’entre elles sont absorbées par l’ennemi, et réapparaissent transformées... pour attaquer
l’académie Genetics ! S’ensuit une bataille sanglante où tombent de nombreuses jeunes filles. Inarrêtable, cet étrange ennemi parvient à pénétrer jusqu'au cœur de l’académie, où Satellizer et ses amis tentent en vain de les arrêter. Alors que la situation semble désespérée, Elisabeth apparaît. Elle semble avoir trouvé le point faible des fausses Pandora. Fort de ce nouvel espoir, nos vaillantes héroïnes lancent la contre-attaque !