2017, Area 11. Nunnaly Lamperouge vit avec son frère Lelouch au sein de l’académie Ashford. Mais le jour où celui-ci disparaît, assassiné par l’armée britannienne, quelque chose change au fond de Nunnally ! Elle passe un pacte avec une créature étrange qui lui octroie le pouvoir de se venger par le biais d’un robot sous son contrôle.