Hitomi, un ex-Code:Breaker qui maîtrise l’électricité enlève le premier ministre Fujiwara. Il veut l’exécuter ainsi que des dizaines de milliers de personnes innocentes dans tout le Japon en faisant exploser des bombes... Ôgami, Toki, Heiké, Kanda, et, bien sûr, Sakura vont tout faire pour empêcher que Hitomi n’aille jusqu’au bout de son projet…